本編をクリアするとエクストラメニューにサウンドテストが追加される。 しかしクリア前でもタイトル画面で十字キーを「↑・↓・←・→・↑」の順に入力するとサウンドテストが一時的に解放される(リセットするとまたコマンドを入れる必要がある)。 コマンド入力が成功するとFC版『外伝』のレベルアップ時ファンファーレが鳴る。ちなみにFC版でも同様の方法でサウンドテストが開放可能だった。 またFC版でイージーモードを出現させるコマンドを本作で入力しても何も起こらない。 クリア後はこのコマンドを入力してもファンファーレは聴けなくなるので、微妙に取り返しのつかない要素である(全データを削除すれば再び聴くことは可能)。
戦闘アニメでAを押しっぱなし(早送り)にしていると、必殺カットイン時のボイスがたまに消える(再生されない)ことがある。
5章のタイトルは初めは「再会、そして?」という表記だったが、これは文字化けだったようでver1.1の更新を行うと「再会、そして…」という正しい表記に修正される。
1章のアルム側でクリフとエフィを仲間にせず、2章のセリカ側でラムの村を訪れ彼らと会話すると、セリカ軍に加入させることができる。 仲間にする際の会話も専用のものだが、拠点会話は発生しない。 またシルク・フォルス・パイソンを1章で仲間にしなかった場合もそれぞれに話しかけると専用の会話になるが、仲間にすることはできない。