「白夜王国編」「暗夜王国編」「インビジブルキングダム(透魔)編」の3つが存在し、ストーリーや仲間になるユニットの他、全体的な難易度やゲーム性が異なる。
全体的な難易度を選択する。 難易度が上がると敵の数、ステータス、武器、スキルが強化され、一部ギミックの仕様も変わる。 ルートによっても難易度は異なるため、どの難易度にするか迷った場合は下記も参考に。
自軍ユニットが倒された(HPが0になった)時の扱いを選ぶ。